Elektordeionizácia v posledných rokoch nahrádza Ionomeničové systémy, ktoré zaťažujú odpadové vody pri regeneráciach silnými kyselinami a lúhmi. EDI vyrába vysokokvalitnú vodu s odporom aj 18,2 MΩ (0,05 μS/cm), prakticky nevodivú vodu. Využíva sa preto najmä pri výrobe elektroniky, vo farmaceutickom a energetickom priemysle.